Šiame skyriuje aprašyta, kaip pasirašyti vieną dokumentą. Dokumentų paketo pasirašymas aprašytas skyriuje 4.12.1 Pasirašyti dokumentų paketą.
1. Paspausti
mygtuką „Pasirašyti“ lango viršuje dešinėje. Pasirašymo funkcionalumas
taip pat gali būti iškviestas nuoroda Pasirašyti išskleistame meniu
(išskleidžiamas paspaudus 
prie mygtuko Pasirašyti).
Sistema atidaro langą, kuriame galima pasirinkti pasirašymo būdą: Pasirašyti stacionariu elektroniniu parašu arba Pasirašyti mobiliu elektroniniu parašu, nutraukti pasirašymą bei peržiūrėti pasirašomo dokumento .pdf formą.
Pastaba.
Paspaudus mygtuką „Pasirašyti“, sistema išmeta JAVA įskiepio paleidimo
patvirtinimo langą. Lango išvaizda gali skirtis priklausomai nuo naudojamos
operacinės sistemos bei JAVA kalbos versijos. Visais atvejais būtina
patvirtinti leidimą startuoti JAVA įskiepiui.
Paspaudus
mygtuką Pasirašyti dokumento peržiūros lange, dokumento būsena
pakeičiama į Pateiktas pasirašymui, todėl jei pasirašymo lange
pasirenkama Nutraukti pasirašymą, dokumentas turi būseną Pateiktas
pasirašymui.
2. Pasirinkti pasirašymo būdą. Pasirinkus pasirašymo būdą, pateikiami naudotojo asmeniniame kompiuteryje aptikti prijungti skaitmeniniai pasirašymo sertifikatai ir jų aprašymai pateikiami duomenų lentele:
Sertifikato savininkas – pateikiamas pasirašymo sertifikato
savininko vardas ir pavardė;
Sertifikatą išdavė – pateikiamas įstaigos, išdavusios pasirašymo
sertifikatą, pavadinimas;
Galioja – pateikiamos pasirašymo sertifikato galiojimo nuo ir iki
datos.
3.
Paspausti „Pasirašyti“. Paspaudus mygtuką 
,
sistema pateikia PIN kodo įvedimo langą.
4. Įvesti el. parašo sertifikato PIN kodą. Įvedus PIN kodą, atliekamas dokumento pasirašymo veiksmas. PIN kodas įvedamas programinėje įrangoje, kuri skiriasi priklausomai nuo naudojamo pasirašymo sertifikato tipo. Sėkmingai įvykus siuntos elektroninio pasirašymo veiksmui, sistema atidaro langą, kuriame pateikia sėkmės pranešimą; lange yra nuoroda į pasirašyto dokumento .pdf formą, nuoroda į pasirašyto dokumento peržiūros langą.
Naudingos
nuorodos elektroninio pasirašymo programinės įrangos įdiegimui:
• Elektroninės asmens tapatybės kortelės ir sertifikatų programinė įranga: http://www.eid.lt/naujas_eid/lt/jus-turite-atk/ko-jums-reikia/korteles-ir-sertifikatu-p-c4u6.html.
• Elektroninių sertifikatų diegimo ir taikymo instrukcijos: http://www.elektroninis.lt/lt/paruosti-kompiuteri.